案情描述： 甲方：地主方，乙方：投資方 合作建房合同主要約定： 1.合作模式：2010年，甲方出400平方地與乙方共建，甲乙雙方按前后切割各獲一半土地使用權(quán)，乙方建一棟完整的6層樓給甲方。 2.乙方負(fù)責(zé)辦理雙方的獨(dú)立房產(chǎn)權(quán)，同時(shí)繳納40萬(wàn)保證金，每推遲1年辦好，扣除保證金10萬(wàn)，直到辦成。 現(xiàn)狀：在房屋建造過(guò)程中，政府批準(zhǔn)5層半，但乙方已為甲方蓋樓6層，乙方自行蓋樓9層，目前正常使用?，F(xiàn)因?yàn)樯婕斑`建，批復(fù)的施工圖是前后合體一棟5層樓，實(shí)際建造為前后切割各成一棟獨(dú)立的樓，且樓層數(shù)超原批復(fù)5層辦，實(shí)際蓋房與批復(fù)的施工圖不一致，無(wú)法辦理獨(dú)立的房屋證書(shū)。請(qǐng)求下一步如何處理，最大化甲方利益。