《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》（國家稅務(wù)總局公告2011年第50號）：
一、對增值稅一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進項稅額。

增值稅一般納稅人由于除本公告第二條規(guī)定以外的其他原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，仍應(yīng)按照增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。

本公告所稱增值稅扣稅憑證，包括增值稅專用發(fā) ; 票、海關(guān)進口增值稅專用繳款書和公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā) ; 票。

二、客觀原因包括如下類型：

（一）因自然災(zāi)害、社會突發(fā)事件等不可抗力因素造成增值稅扣稅憑證逾期；

（二）增值稅扣稅憑證被盜、搶，或者因郵寄丟失、誤遞導(dǎo)致逾期；

（三）有關(guān)司法、行政機關(guān)在辦理業(yè)務(wù)或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，納稅人不能正常履行申報義務(wù)，或者稅務(wù)機關(guān)信息系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)故障，未能及時處理納稅人網(wǎng)上認證數(shù)據(jù)等導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（四）買賣雙方因經(jīng)濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證，或者納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務(wù)登記的時間過長，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（五）由于企業(yè)辦稅人員傷亡、突發(fā)危重疾病或者擅自離職，未能辦理交接手續(xù)，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期；

（六）國家稅務(wù)總局規(guī)定的其他情形。

三、增值稅一般納稅人因客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，可按照本公告附件《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》的規(guī)定，申請辦理逾期抵扣手續(xù)。

四、本公告自2011年10月1日起執(zhí)行。

《國家稅務(wù)總局關(guān)于進一步優(yōu)化增值稅、消費稅有關(guān)涉稅事項辦理程序的公告》（國家稅務(wù)總局公告2017年第36號）：
一、自2018年1月1日起，逾期增值稅扣稅憑證繼續(xù)抵扣事項由省國稅局核準(zhǔn)。
允許繼續(xù)抵扣的客觀原因類型及報送資料等要求，按照修改后的《國家稅務(wù)總局關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2011年第50號）執(zhí)行。

如果增值稅專用發(fā)票已超過認證期限，這個是無法再開具紅字專用發(fā)票的，只能把原先這17%進項稅額全部記入到成本里去才行的；這樣也就是相當(dāng)于損失了0.17的稅額了。
具體規(guī)定如下。

增值稅扣稅憑證抵扣期限在《國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)問題的通知》（國稅函〔2009〕617號）中有明確規(guī)定，即增值稅一般納稅人取得增值稅專用發(fā)票、公路內(nèi)河貨物運輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機動車銷售統(tǒng)一發(fā)票，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)到稅務(wù)機關(guān)辦理認證，并在認證通過的次月申報期內(nèi)，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額。
實行海關(guān)進口增值稅專用繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)向主管稅務(wù)機關(guān)報送《海關(guān)完稅憑證抵扣清單》（包括紙質(zhì)資料和電子數(shù)據(jù)）申請稽核比對。
未實行海關(guān)繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人取得的海關(guān)繳款書，應(yīng)在開具之日起180日后的第一個納稅申報期結(jié)束以前，向主管稅務(wù)機關(guān)申報抵扣進項稅額。

　　按照上述文件規(guī)定，納稅人未在規(guī)定期限內(nèi)認證申報抵扣進項稅的，其進項稅額不得抵扣。
考慮到實際執(zhí)行中的特殊問題，國家稅務(wù)總局規(guī)定有兩種情況可以繼續(xù)抵扣進項稅額，應(yīng)引起納稅人的注意。

第一，增值稅扣稅憑證已認證或已采集上報信息，但未按照規(guī)定期限申報抵扣的，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于未按期申報抵扣增值稅扣稅憑證有關(guān)問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2011年第78號）規(guī)定，增值稅一般納稅人取得的增值稅扣稅憑證已認證或已采集上報信息但未按照規(guī)定期限申報抵扣；實行納稅輔導(dǎo)期管理的增值稅一般納稅人以及實行海關(guān)進口增值稅專用繳款書“先比對后抵扣”管理辦法的增值稅一般納稅人，取得的增值稅扣稅憑證稽核比對結(jié)果相符但未按規(guī)定期限申報抵扣，屬于發(fā)生真實交易且屬客觀原因的，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核，允許納稅人繼續(xù)申報抵扣其進項稅額。

第二，增值稅扣稅憑證未認證或未采集上報信息，且逾期即超期申報扣稅憑證的，根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國家稅務(wù)總局公告2011年第50號）規(guī)定，增值稅一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務(wù)機關(guān)審核、逐級上報，由國家稅務(wù)總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進項稅額。

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根據(jù)《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》規(guī)定納稅人申請辦理逾期抵扣時，應(yīng)報送如下資料：

（一）《逾期增值稅扣稅憑證抵扣申請單》；

（二）增值稅扣稅憑證逾期情況說明。
納稅人應(yīng)詳細說明未能按期辦理認證或者申請稽核比對的原因，并加蓋企業(yè)公章。
其中，對客觀原因不涉及第三方的，納稅人應(yīng)說明的情況具體為：發(fā)生自然災(zāi)害、社會突發(fā)事件等不可抗力原因的，納稅人應(yīng)詳細說明自然災(zāi)害或者社會突發(fā)事件發(fā)生的時間、影響地區(qū)、對納稅人生產(chǎn)經(jīng)營的實際影響等；納稅人變更納稅地點，注銷舊戶和重新辦理稅務(wù)登記的時間過長，導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期的，納稅人應(yīng)詳細說明辦理搬遷時間、注銷舊戶和注冊新戶的時間、搬出及搬入地點等；企業(yè)辦稅人員擅自離職，未辦理交接手續(xù)的，納稅人應(yīng)詳細說明事情經(jīng)過、辦稅人員姓名、離職時間等，并提供解除勞動關(guān)系合同及企業(yè)內(nèi)部相關(guān)處理決定。

（三）客觀原因涉及第三方的，應(yīng)提供第三方證明或說明。
具體為：企業(yè)辦稅人員傷亡或者突發(fā)危重疾病的，應(yīng)提供公安機關(guān)、交通管理部門或者醫(yī)院證明；有關(guān)司法、行政機關(guān)在辦理業(yè)務(wù)或者檢查中，扣押增值稅扣稅憑證，導(dǎo)致納稅人不能正常履行申報義務(wù)的，應(yīng)提供相關(guān)司法、行政機關(guān)證明；增值稅扣稅憑證被盜、搶的，應(yīng)提供公安機關(guān)證明；買賣雙方因經(jīng)濟糾紛，未能及時傳遞增值稅扣稅憑證的，應(yīng)提供賣方出具的情況說明；郵寄丟失或者誤遞導(dǎo)致增值稅扣稅憑證逾期的，應(yīng)提供郵政單位出具的說明。

（四）逾期增值稅扣稅憑證電子信息；

（五）逾期增值稅扣稅憑證復(fù)印件（復(fù)印件必須整潔、清晰，在憑證備注欄注明“與原件一致”并加蓋企業(yè)公章，增值稅專用發(fā)票復(fù)印件必須裁剪成與原票大小一致）。

零申報逾期不用繳納滯納金，但是要看專管員的決定罰你們多少，最少是100元，填好申報表蓋上公章，去柜臺申報。

你應(yīng)該去找國稅局，因為是他們那邊出問題了，“以前核定稅種時核定錯了”。
讓他們幫你解決。

過期發(fā)票不允許沖紅票了，也就是說開票方不會給你重開了，看你們公司如何規(guī)定了，要么公司進項稅都進成本，要么你作為責(zé)任人把這部分稅款損失補上。

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