鑒定意見書盡管不是最終的結(jié)論，但是其關(guān)系到當(dāng)事人的切身利益，對案件的處理結(jié)果有較大影響。鑒定意見書在法理上可以說是一種專家意見書，其鑒定意見通常和鑒定人的技術(shù)水平，鑒定設(shè)備鑒定標(biāo)本有著直接的關(guān)系，任何一個環(huán)節(jié)的問題具有可能導(dǎo)致結(jié)果的不同，甚至錯誤。即使程序上合法、公正的鑒定意見當(dāng)事人也可能會存在爭議，因此最高人民法院《關(guān)于民事訴訟證據(jù)的若干規(guī)定》規(guī)定當(dāng)事人有證據(jù)證明鑒定結(jié)論有問題的，可以申請重新鑒定。

兩份鑒定意見的鑒定機構(gòu)均具備合法的鑒定資質(zhì)，鑒定的程序合法，鑒定的內(nèi)容也完備。但是鑒定意見卻完全不同，那么哪一份鑒定意見書證明力更高，法院應(yīng)該采信哪一份鑒定意見書呢?關(guān)于鑒定意見之間的效力問題，法律沒有明確的規(guī)定，《全國人民代表大會常務(wù)委員會關(guān)于司法鑒定管理問題的決定》也僅僅對司法鑒定人員的管理，鑒定機構(gòu)的設(shè)置，以及司法鑒定機構(gòu)的運行管理制度作出規(guī)定，但是對各個鑒定機構(gòu)之間的關(guān)系，鑒定機構(gòu)鑒定的地域范圍，以及鑒定意見的效力等級，未做規(guī)定。

在庭審中經(jīng)常會出現(xiàn)不同的鑒定意見的情現(xiàn)象，法官認(rèn)定的時候往往是根據(jù)案件的案情，以及經(jīng)驗對鑒定意見書作出認(rèn)定。主要考慮有以下幾點：

1、鑒定意見書的來源，是不是由法院委托的，法院委托鑒定機構(gòu)作出的鑒定意見優(yōu)先于其他來源的鑒定意見。主要原因有，目前鑒定意見的來源主要有，自行委托鑒定、交警部門委托鑒定、法院委托鑒定，自行委托鑒定和交警部門委托鑒定的一般稱為鑒定意見書而非司法鑒定意見書，而且其在鑒定機構(gòu)的選擇通常也沒有征得被告方的同意，被告方往往以不知道、單方委托，不公正，鑒定機構(gòu)偏向委托人作出有利于委托的人鑒定意見為由，不認(rèn)可這些鑒定意見。因此其在證明力上較法院委托的司法鑒定較低，法院委托鑒定通常需要征詢雙方的意見，協(xié)商確定鑒定機構(gòu)，協(xié)商不成的通常采取抽簽搖號的方式確定鑒定機構(gòu)，并且會形成筆錄，記錄在卷，程序上公開公正，雙方當(dāng)事人均較為信服。

2、鑒定資質(zhì)較高的鑒定機構(gòu)出具的鑒定意見效力優(yōu)先于其他鑒定意見。因為，盡管鑒定機構(gòu)沒有等級效力之分，但是鑒定機構(gòu)的鑒定設(shè)備，鑒定技術(shù)，鑒定人的鑒定經(jīng)驗往往較之其他鑒定機構(gòu)的鑒定意見更能反映事情的原貌。

3、鑒定意見書詳實、客觀、鑒定意見理由充分的優(yōu)先其他鑒定意見書。鑒定意見書，是鑒定人對該專業(yè)領(lǐng)域的專門問題向司法機關(guān)提供的結(jié)論意見，是鑒定人在觀察、檢驗、分析等科學(xué)技術(shù)活動上得出的主觀結(jié)論，是一種意見證據(jù)。是否采納該鑒定意見，鑒定人對送檢材料的充分了解，檢驗過程科學(xué)合理、先進(jìn)，分析意見充分詳細(xì)，那么該鑒定意見則更能說服法官采信該意見。

對于你提出的“兩份司法鑒定結(jié)論不一致,法院如何認(rèn)定”問題，司法鑒定兩份結(jié)論不一樣的話，那么就看是不是法院委托的，喲啊汗死不是的話，那么就選擇另一個司法鑒定結(jié)果，要是一樣的，以鑒定資質(zhì)高的為準(zhǔn)。你可以咨詢律聊網(wǎng)的律師。